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水质评价系统在人工巡测及自动采集水质监测数据的基础上，按照选定标准对地表水、地下水、入河排污口等的水质进行评价，及时预警水质异常，并对水体的水质状况和动态变化趋势进行分析，进而帮助水环境监测部门及时、准确地掌握水环境状况。系统的建立为水功能区限制纳污红线管理提供规范的水质评价数据，为水环境管理与保护水资源提供科学依据。